Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC1P41238 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms