Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCA1P38398 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRCA1P38398 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA1P38398 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms