Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD13P35453 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD13P35453 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms