Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CLIP1P30622 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLIP1P30622 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms