Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF1P30408 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms