Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms