Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD10P28358 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms