Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms