Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms