Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA3P25788 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms