Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSSP25774 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSSP25774 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTSSP25774 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTSSP25774 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms