Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PRKCHP24723 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PRKCHP24723 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PRKCHP24723 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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