Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRBP23467 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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