Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB1P20700 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms