Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD33P20138 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD33P20138 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD33P20138 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD33P20138 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms