Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATF3P18847 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATF3P18847 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATF3P18847 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF3P18847 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF3P18847 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF3P18847 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATF3P18847 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF3P18847 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF3P18847 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF3P18847 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF3P18847 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF3P18847 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATF3P18847 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATF3P18847 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATF3P18847 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATF3P18847 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF3P18847 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF3P18847 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms