Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RCC1P18754 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RCC1P18754 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RCC1P18754 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RCC1P18754 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RCC1P18754 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RCC1P18754 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms