Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNB3P16520 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB3P16520 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms