Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms