Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXB3P14651 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms