Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM27P14373 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms