Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC130P13994 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms