Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG2P13521 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG2P13521 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms