Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms