Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRM1P11229 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRM1P11229 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRM1P11229 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRM1P11229 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRM1P11229 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRM1P11229 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM1P11229 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM1P11229 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM1P11229 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM1P11229 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM1P11229 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRM1P11229 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms