Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms