Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM200BP0CF97 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM200BP0CF97 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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