Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR29P0C7W0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms