Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSLP07711 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSLP07711 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSLP07711 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSLP07711 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTSLP07711 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTSLP07711 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSLP07711 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSLP07711 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSLP07711 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms