Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms