Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV12-3P01733 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms