Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4AO75164 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms