Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms