Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPLO60437 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPLO60437 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPLO60437 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPLO60437 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPLO60437 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPLO60437 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPLO60437 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PPLO60437 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPLO60437 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPLO60437 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPLO60437 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPLO60437 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPLO60437 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPLO60437 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPLO60437 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPLO60437 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPLO60437 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms