Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms