Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP104O60308 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CEP104O60308 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CEP104O60308 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP104O60308 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP104O60308 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP104O60308 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms