Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A2O14975 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms