Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms