Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms