Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QKU1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QKU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QKU1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QKU1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QKU1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QKU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QKU1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms