Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H7C0C1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H7C0C1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H7C0C1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H7C0C1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H7C0C1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H7C0C1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H7C0C1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms