Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPB9F8W1W9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPIPB9F8W1W9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms