Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRM5B3KS81 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRM5B3KS81 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms