Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms