Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYSRT1A8MQ03 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms