Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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