Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YJEFN3A6XGL0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms