Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms