Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf92A6NGG3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms