Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms